Bakterietypning
Dianova tilbyder typning af Salmonella og andre fødevarebårne bakterier som for eksempel Campylobacter, E. coli, mv. DTU Fødevareinstituttet, der er nationalt referencelaboratorium, udfører typningen.
Opsporing af kilder til kontaminering
Karakterisering af bakterier bidrager til at løse afgrænsede problemer i forbindelse med personer, der er smittebærere eller materialer og produktionsanlæg, som er forurenet med bakterien. For eksempel kan Salmonella isoleret fra forskellige steder i produktionen medvirke til at opklare årsagen til forurening af produktet. Desuden kan karakterisering ved typebestemmelse belyse den mest sandsynlige overførselsvej for infektion mellem flokke af dyr eller fra foder.
Typningsmetoder
Serotypning
Karakteriser bakterier ved identifikation af overfladeantigener (o-antigen, LPS, lipopolysaccharid) og antigener fra flageller (H-antigener). Karakteriseringen udtrykkes som en antigenformel; dvs. 0:4,12; H:i:1,2 for Salmonella Typhimurium eller 0157 for en af de almindelige typer verotoksindannende E. coli.
Fagtypning
Karakteriserer hvert isolat på basis af dets følsomhed overfor en serie forskellige bakterievira(fager). Fagtyperne benævnes med bogstaver og nummer; dvs. DT 104 for S. Typhimurium eller
PT4 for S. Enteritidis. Anvendes ved yderligere undersøgelse af de mest almindelige typer.
Antibiotikaresistens
Karakteriserer bakterier ved deres følsomhed eller resistens overfor forskellige antibiotika, der anvendes til behandling af infektioner hos mennesker eller dyr. For eksempel MRSA (Methicillinresistent Staphylococcus aureus) vancomycinresistente enterokokker eller ESBL bakterier (Extended Spectrum Betalactamase).
Molekylær typning
Karakteriserer bakterier på basis af forskelligheder eller ligheder i bakteriegenomet eller udfra tilstedeværelsen af specifikke gener. ”Pulse Field Gel Electrophoresis” (PFGE) og ”Multi-locus
variable-number tandem repeat analysis” (MLVA) anvendes sædvanligvis til molekylær typningmetoder. MLVA er implementeret for Salmonella Typhimurium.
Molekylær typning anvendes i særlige situationer, specielt når der er infektion i fødevareproduktionen, eller når spredning mellem dyr, fødevarer og mennesker skal efterforskes særligt
grundigt. For eksempel ved påvisning af gener, der giver resistens overfor vigtige antibiotika i behandlingen af mennesker og dyr.
|
